Protein–RNA interactions for Protein: Q93034

CUL5, Cullin-5, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL5Q93034 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CUL5Q93034 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
CUL5Q93034 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CUL5Q93034 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CUL5Q93034 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms