Protein–RNA interactions for Protein: Q92753

RORB, Nuclear receptor ROR-beta, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORBQ92753 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RORBQ92753 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORBQ92753 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORBQ92753 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORBQ92753 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORBQ92753 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RORBQ92753 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORBQ92753 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RORBQ92753 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RORBQ92753 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RORBQ92753 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RORBQ92753 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RORBQ92753 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RORBQ92753 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RORBQ92753 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORBQ92753 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORBQ92753 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORBQ92753 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RORBQ92753 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RORBQ92753 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RORBQ92753 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RORBQ92753 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
RORBQ92753 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RORBQ92753 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms