Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN0

ATG4A, Cysteine protease ATG4A, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AQ8WYN0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ATG4AQ8WYN0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATG4AQ8WYN0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATG4AQ8WYN0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATG4AQ8WYN0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.4 ms