Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW32

HMGB4, High mobility group protein B4, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB4Q8WW32 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGB4Q8WW32 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGB4Q8WW32 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGB4Q8WW32 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGB4Q8WW32 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms