Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVP7

LMBR1, Limb region 1 protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBR1Q8WVP7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.54■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LMBR1Q8WVP7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
LMBR1Q8WVP7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
LMBR1Q8WVP7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LMBR1Q8WVP7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms