Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV22

NSMCE1, Non-structural maintenance of chromosomes element 1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1Q8WV22 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NSMCE1Q8WV22 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NSMCE1Q8WV22 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NSMCE1Q8WV22 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NSMCE1Q8WV22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms