Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC12Q8WUD4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC12Q8WUD4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC12Q8WUD4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC12Q8WUD4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms