Protein–RNA interactions for Protein: Q8TEB9

RHBDD1, Rhomboid-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD1Q8TEB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RHBDD1Q8TEB9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RHBDD1Q8TEB9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RHBDD1Q8TEB9 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RHBDD1Q8TEB9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms