Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDR2

STK35, Serine/threonine-protein kinase 35, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STK35Q8TDR2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STK35Q8TDR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
STK35Q8TDR2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
STK35Q8TDR2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
STK35Q8TDR2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms