Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAP4

LMO3, LIM domain only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3Q8TAP4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LMO3Q8TAP4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
LMO3Q8TAP4 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
LMO3Q8TAP4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LMO3Q8TAP4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms