Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

Predictions only

Length 707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CNNM3Q8NE01 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CNNM3Q8NE01 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CNNM3Q8NE01 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CNNM3Q8NE01 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms