Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB78

KDM1B, Lysine-specific histone demethylase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM1BQ8NB78 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KDM1BQ8NB78 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
KDM1BQ8NB78 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KDM1BQ8NB78 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KDM1BQ8NB78 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms