Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA58

PNLDC1, Poly(A)-specific ribonuclease PNLDC1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNLDC1Q8NA58 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PNLDC1Q8NA58 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PNLDC1Q8NA58 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PNLDC1Q8NA58 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PNLDC1Q8NA58 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms