Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA56

TTC29, Tetratricopeptide repeat protein 29, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC29Q8NA56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TTC29Q8NA56 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TTC29Q8NA56 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TTC29Q8NA56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC29Q8NA56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms