Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9U0

TC2N, Tandem C2 domains nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TC2NQ8N9U0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TC2NQ8N9U0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
TC2NQ8N9U0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
TC2NQ8N9U0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TC2NQ8N9U0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms