Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DTX3Q8N9I9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DTX3Q8N9I9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DTX3Q8N9I9 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms