Protein–RNA interactions for Protein: Q8N806

UBR7, Putative E3 ubiquitin-protein ligase UBR7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBR7Q8N806 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
UBR7Q8N806 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
UBR7Q8N806 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
UBR7Q8N806 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
UBR7Q8N806 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms