Protein–RNA interactions for Protein: Q8N427

NME8, Thioredoxin domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME8Q8N427 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
NME8Q8N427 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
NME8Q8N427 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
NME8Q8N427 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
NME8Q8N427 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms