Protein–RNA interactions for Protein: Q8N350

CBARP, Voltage-dependent calcium channel beta subunit-associated regulatory protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBARPQ8N350 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CBARPQ8N350 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CBARPQ8N350 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CBARPQ8N350 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CBARPQ8N350 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms