Protein–RNA interactions for Protein: Q8N228

SCML4, Sex comb on midleg-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCML4Q8N228 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SCML4Q8N228 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SCML4Q8N228 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SCML4Q8N228 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SCML4Q8N228 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms