Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1V2

CFAP52, Cilia- and flagella-associated protein 52, humanhuman

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP52Q8N1V2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP52Q8N1V2 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CFAP52Q8N1V2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFAP52Q8N1V2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
CFAP52Q8N1V2 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CFAP52Q8N1V2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
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