Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NAGSQ8N159 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NAGSQ8N159 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NAGSQ8N159 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms