Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC117Q8IWD4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC117Q8IWD4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC117Q8IWD4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC117Q8IWD4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms