Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CCDC71Q8IV32 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC71Q8IV32 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC71Q8IV32 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC71Q8IV32 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms