Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SNX29P2Q8IUI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SNX29P2Q8IUI4 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SNX29P2Q8IUI4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SNX29P2Q8IUI4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms