Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PPFIBP1Q86W92 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PPFIBP1Q86W92 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PPFIBP1Q86W92 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPFIBP1Q86W92 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPFIBP1Q86W92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms