Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
UBE3BQ7Z3V4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.89■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
UBE3BQ7Z3V4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
UBE3BQ7Z3V4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
UBE3BQ7Z3V4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3BQ7Z3V4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
UBE3BQ7Z3V4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.9 ms