Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC46A3Q7Z3Q1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms