Protein–RNA interactions for Protein: Q7LBR1

CHMP1B, Charged multivesicular body protein 1b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP1BQ7LBR1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CHMP1BQ7LBR1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CHMP1BQ7LBR1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHMP1BQ7LBR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP1BQ7LBR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.2 ms