Protein–RNA interactions for Protein: Q7L8C5

SYT13, Synaptotagmin-13, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT13Q7L8C5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT13Q7L8C5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SYT13Q7L8C5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SYT13Q7L8C5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SYT13Q7L8C5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms