Protein–RNA interactions for Protein: Q7L804

RAB11FIP2, Rab11 family-interacting protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP2Q7L804 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP2Q7L804 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RAB11FIP2Q7L804 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RAB11FIP2Q7L804 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.52■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
RAB11FIP2Q7L804 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB11FIP2Q7L804 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP2Q7L804 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB11FIP2Q7L804 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.5 ms