Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV73

FGD6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD6Q6ZV73 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.68■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC37.64■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.62
FGD6Q6ZV73 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC37.61■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
FGD6Q6ZV73 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC37.54■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
FGD6Q6ZV73 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
FGD6Q6ZV73 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
FGD6Q6ZV73 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms