Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSC3

RBM43, RNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM43Q6ZSC3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RBM43Q6ZSC3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.57■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.55■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
RBM43Q6ZSC3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
RBM43Q6ZSC3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RBM43Q6ZSC3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RBM43Q6ZSC3 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.8 ms