Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS4

CCDC129, Coiled-coil domain-containing protein 129, humanhuman

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC129Q6ZRS4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC129Q6ZRS4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC129Q6ZRS4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC129Q6ZRS4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CCDC129Q6ZRS4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC129Q6ZRS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms