Protein–RNA interactions for Protein: Q6X9E4

FBXW12, F-box/WD repeat-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW12Q6X9E4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
FBXW12Q6X9E4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
FBXW12Q6X9E4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FBXW12Q6X9E4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms