Protein–RNA interactions for Protein: Q6VY07

PACS1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1Q6VY07 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PACS1Q6VY07 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PACS1Q6VY07 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PACS1Q6VY07 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms