Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TMC5Q6UXY8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TMC5Q6UXY8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TMC5Q6UXY8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TMC5Q6UXY8 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TMC5Q6UXY8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms