Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
VITQ6UXI7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
VITQ6UXI7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
VITQ6UXI7 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
VITQ6UXI7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms