Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PCSK4Q6UW60 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PCSK4Q6UW60 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PCSK4Q6UW60 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PCSK4Q6UW60 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 222.7 ms