Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DUX4L9Q6RFH8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
DUX4L9Q6RFH8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
DUX4L9Q6RFH8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DUX4L9Q6RFH8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms