Protein–RNA interactions for Protein: Q6QNY1

BLOC1S2, Biogenesis of lysosome-related organelles complex 1 subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BLOC1S2Q6QNY1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BLOC1S2Q6QNY1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BLOC1S2Q6QNY1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
BLOC1S2Q6QNY1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
BLOC1S2Q6QNY1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
BLOC1S2Q6QNY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
BLOC1S2Q6QNY1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
BLOC1S2Q6QNY1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
BLOC1S2Q6QNY1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms