Protein–RNA interactions for Protein: Q6PIY7

PAPD4, Poly(A) RNA polymerase GLD2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPD4Q6PIY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PAPD4Q6PIY7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PAPD4Q6PIY7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PAPD4Q6PIY7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PAPD4Q6PIY7 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms