Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF04

ZNF613, Zinc finger protein 613, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF613Q6PF04 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF613Q6PF04 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF613Q6PF04 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF613Q6PF04 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF613Q6PF04 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF613Q6PF04 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF613Q6PF04 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF613Q6PF04 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZNF613Q6PF04 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.2 ms