Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZCCHC12Q6PEW1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZCCHC12Q6PEW1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZCCHC12Q6PEW1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms