Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB7

SLC27A1, Long-chain fatty acid transport protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A1Q6PCB7 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A1Q6PCB7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A1Q6PCB7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC27A1Q6PCB7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC27A1Q6PCB7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC27A1Q6PCB7 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC27A1Q6PCB7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC27A1Q6PCB7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms