Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVU6

UFSP1, Inactive Ufm1-specific protease 1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFSP1Q6NVU6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
UFSP1Q6NVU6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
UFSP1Q6NVU6 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
UFSP1Q6NVU6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms