Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
LRRC8EQ6NSJ5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRRC8EQ6NSJ5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
LRRC8EQ6NSJ5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRRC8EQ6NSJ5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms