Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DUPD1Q68J44 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
DUPD1Q68J44 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
DUPD1Q68J44 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
DUPD1Q68J44 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms