Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATG16L1Q676U5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ATG16L1Q676U5 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATG16L1Q676U5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATG16L1Q676U5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms