Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTA0

PRAMEF17, PRAME family member 17, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17Q5VTA0 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRAMEF17Q5VTA0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRAMEF17Q5VTA0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRAMEF17Q5VTA0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms